Academy City está na vanguarda do progresso científico e tecnológico, mais conhecido por seu desenvolvimento de espers: aqueles capazes de exercer habilidades sobre-humanas que alteram as regras da realidade. Os mais poderosos entre eles são os de Nível 5, e aquele conhecido como Acelerador reina supremo, mesmo depois de ter sido enfraquecido por uma grave lesão cerebral. Ao seu lado está a jovem conhecida como Última Ordem, que apesar de seu comportamento frio, ele mantém de perto e promete proteger a todo custo.
Embora Accelerator possa estar se recuperando de sua lesão, o lado sombrio de Academy City nunca descansa, e então ele se vê involuntariamente preso no meio de um novo conflito. Quando uma jovem misteriosa se aproxima da Accelerator em busca da Last Order, o esper mais bem classificado é confrontado por uma organização venenosa que se enraizou na Anti-Skill, a organização de manutenção da paz da Academy City. Com forças perigosas em movimento que ameaçam colocar Last Order e suas irmãs em risco, o autoproclamado vilão se prepara para entrar na escuridão mais uma vez.
[Escrito por MAL Rewrite]