Cinquenta anos atrás, criaturas misteriosas conhecidas como ‘Huge’ apareceram de repente em todo o mundo, representando uma ameaça existencial para a humanidade. Para se defender contra essas ameaças, os soldados na forma de adolescentes conhecidas como ‘Lilies’ usam a energia ‘Magie’ dentro de seus corpos para alimentar armas chamadas ‘Contra Huge ARMS’ ou ‘CHARMS’.
Depois de ser salva por uma Lily há dois anos, enquanto evacuava de um ataque enorme, Riri Hitotsuyanagi prometeu se tornar uma Lily. Ela se matricula na prestigiosa academia de Yurigaoka, um campo de treinamento para Lilies, e descobre que uma de suas colegas de classe é Yuyu Shirai – a mesma Lily que a resgatou. Para sua confusão, no entanto, a pessoa que ela pensava ser alegre acaba sendo bastante anti-social e prefere lutar sozinha. Mesmo assim, Riri ainda deseja se dar bem com Yuyu e está disposta a fazer tudo o que puder para alcançar esse objetivo.
Com Yuyu e os outros Lilies ao seu lado, a jornada de Riri para se tornar um deles acabou de florescer!
[Escrito por MAL Rewrite]