O jogo se passa em um futuro distante em uma dimensão paralela chamada Cosmic Ark. Há uma raça de robôs gigantes e há muito adormecidos chamados Arks, que de repente despertaram para encontrar sua galáxia sendo governada pelo malvado Chaos. Desde que ficaram adormecidos por eras, as três grandes Arcas de Sabedoria, Coragem e Força restantes foram drenadas de sua energia, e agora resta apenas energia suficiente para uma delas ser revivida com o poder de vencer o malvado Caos. Para conseguir isso, três diferentes Uniões de seguidores de cada uma das grandes Arcas se formaram, cada uma competindo pelo renascimento de sua respectiva Arca e, assim, pela derrota do Caos e pelo destino do mundo.
Além desta história abrangente, existem várias histórias de fundo dos personagens do jogo. Há, por exemplo, o pano de fundo de Crimrose e Ivis, a história de Eihwaz, ou o encontro entre Eris e Resha entre outros.
(Fonte: Wikipédia)
