Kei Narutani e seu amigo de infância, Song Minghua, são refugiados chineses que estão fugindo do Zai, uma organização misteriosa que aterroriza indiscriminadamente seu país e seu povo. Felizmente, durante sua fuga para o Japão, eles são salvos por uma estranha aeronave vermelha.
O fascínio de Kei por esta aeronave o leva a conhecer sua salvadora: uma garota que é uma ‘Anima’ – a piloto de um tipo único de avião chamado ‘Filha’. A garota se chama Gripen, um adorável caça JAS-39F. Kei desenvolve um vínculo com o Gripen e é então recrutado pela Força de Autodefesa do Japão para ajudar o Gripen a superar seus problemas com o vôo.
Mais tarde, acompanhado por Eagle, um despreocupado F-15J-ANM, e Phantom, um orgulhoso RF-4EJ-ANM, o esquadrão pega em armas, determinado a proteger a humanidade. Juntos, os cinco indivíduos lutam contra o invasor Zai, formando a última linha de defesa contra a força alienígena ameaçadora.
[Escrito por MAL Rewrite]
